《尼尔：机械纪元》并非传统电视剧形式，没有严格意义上的“分集剧情”。
它是一款动作角色扮演游戏，其剧情通过游戏流程推进来展现。
以下为你梳理其主要剧情、结局以及相关角色信息： 主要角色 2B：游戏主角之一，隶属于YoRHa部队的人造人女性。
她外表冷酷，执行任务时冷静果断，但随着剧情发展，内心的情感逐渐显露。
9S：同样是YoRHa部队的人造人，擅长黑客攻击，拥有天真好奇的性格，与2B一同执行任务，对2B怀有特殊的感情。
A2：曾经的YoRHa成员，后来成为逃兵。
性格直率，战斗经验丰富，背负着过去的伤痛。
主要剧情 游戏剧情分为多个周目，每个周目玩家会从不同视角体验故事，随着周目的推进，剧情全貌逐渐清晰。
一周目 玩家主要操控2B与9S，他们接到任务前往地球，对抗机械生命体。
在战斗过程中，逐渐发现机械生命体并非简单的敌人，它们似乎有着自己的意识和进化方向。
2B和9S在执行任务时配合默契，不断攻克难关，但也遭遇了各种危险和挑战。
随着探索深入，他们发现了一些关于YoRHa部队以及人类的秘密线索。
二周目 以9S为主视角重新体验游戏流程。
这一周目中，玩家能看到更多9S的内心世界以及他与2B之间微妙的情感变化。
同时，剧情揭示了更多隐藏在背后的真相，比如机械生命体与人类灭亡之间复杂的关系，以及YoRHa部队存在的真正目的。
玩家会发现之前一周目中看似平常的事件背后，其实有着更深层次的含义。
三周目 剧情急转直下，一系列残酷的真相被揭露。
玩家了解到YoRHa部队不过是人类早已灭亡后，为了给人造人活下去的希望而编造的谎言。
2B实际上背负着特殊使命，每当9S发现过于接近真相的机密时，2B就要将其抹杀。
最终，2B为保护9S牺牲，这给9S带来巨大打击，他陷入疯狂复仇状态。
结局 游戏有多结局设定，这里介绍核心结局E结局。
在9S几乎陷入绝望之时，A2出现，她击败了部分敌人，阻止了9S走向自我毁灭。
但A2也身负重伤，最终为了保护9S而牺牲。
之后，9S在其他伙伴的帮助下，战胜最终BOSS。
然而，游戏世界面临着重置危机。
此时，三位神秘的程序实体出现，要求玩家删除存档才能拯救游戏世界。
若玩家选择同意，游戏会播放感人至深的结局动画，一群神秘的机器生命体帮助玩家修复存档数据，象征着即便历经重重苦难，生命依然有着延续和希望。
《尼尔：机械纪元》通过独特的叙事手法和多周目设计，为玩家呈现了一个充满深度和悲剧色彩的科幻世界，探讨了关于生命、意识、人性以及生存意义等深刻主题。